» Info Teknologi » Pusat Genom Pertanian Indonesia (PGPI) Pertama di Indonesia
28 Apr 2022

Kementerian Pertanian melalui Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian (BB Biogen) telah menginisiasi diwujudkannya Konsorsium Genom Badan Litbang Pertanian untuk mendukung penelitian genom di Indonesia. Salah satu target yang akan diwujudkan adalah dibangunnya pusat data (database) genom komoditas pertanian di Indonesia.

PGPI atau pusat genom pertanian Indonesia ini diharapkan akan memberikan kontribusi terhadap penelitian genom komoditas pertanian penting di Indonesia dan mendukung percepatan program pemuliaan.

PGPI (www.genom.litbang.pertanian.go.id) merupakan basis data genom pertama di Indonesia.  Informasi yang dimuat dalam PGPI bersumber dari analisis genom mutakhir dan terkini yaitu hasil re-sekuensing genom, analisis de novo, analisis transkriptom, dan genome-wide genotyping.

Data-data tersebut sangat bermanfaat dalam mempelajari pewarisan sifat unggul komoditas pertanian dan pemuliaannya, serta untuk perlindungan kekayaan hayati dan intelektual sumber daya genetik nasional. Alat/mesin utama yang digunakan untuk menghasilkan data tersebut adalah genome sequencer dan genome-wide genotyper/genome scanner serta peralatan laboratorium biologi molekuler lainnya. 

Pangkalan data ini dibuat dalam enam kategori variasi genom komoditas pertanian, yaitu tanaman palma (kelapa, kelapa sawit, aren), tanaman industri (jarak pagar dan kakao), tanaman hortikultura (cabai, kentang, pisang), tanaman pangan (padi, jagung, kedelai), hewan/ternak (sapi), dan mikroba. Sumber daya genetik (SDG) yang digunakan sebagai materi yang disekuen genomnya dan genotyping merupakan aksesi asal Indonesia, introduksi dan VUB.

Ada dua komponen utama dalam PGPI yaitu pangkalan data dan Penjelajah Genom (Genome Browser). PGPI ini diharapkan akan memberikan kontribusi terhadap penelitian genom komoditas pertanian penting di Indonesia dan mendukung percepatan program pemuliaan. (Muh)